5 сантиметров многим не понравились именно из-за сцены на ЖД переезде.
Как по мне, эта сцена наоборот очень сильная:
Проехавшие поезда символизируют, что их пути разошлись. Поэтому ГГ и не пошёл навстречу своей первой любви, когда поднялся шлагбаум, а направился своим путём.