Ну про Итачи я мог бы тут целое изложение написать. Если с другими примерами автор просто создавал небольшие сюжетные дыры, то тут просто переписанный персонаж, из шизика в героя на ровном месте. Просто потому что он стал популярным.
И мне лично смешно, когда кто-то на серьёзных щах доказывает, что клан учих представлял серьёзную опасность для Конохи)