Я думаю вот как. Куронеко чувствовала, что Кёсуке может её бросить ради сестры, и очень боялась испытать боль и унижение от этого (я сам не раз попадал в подобную ситуацию и испытывал такой страх). Поэтому она решила бросить его сама раньше, чем он успеет это сделать (может, это глупо и по-детски, но ведь и Рури - не мудрый старец, а всего лишь неопытная девочка). А заодно, по доброте душевной, и помочь Кёсуке и Кирино.
Но даже сделав это, она всё равно продолжала его любить и надеяться на то, что и его чувства к ней живы, что это расставание - не по-настоящему, и они снова начнут встречаться. Поэтому окончательный разрыв был для неё таким ударом.