у меня нет точного ответа, но, возможно, все дело в том, что фильм был сделан скорее как анонс (И, возможно, для сбора денег на второй сезон, времени-то много прошло), поэтому и решили допустить такую промежуточную вольность.
возможно, причина как раз в словах Рикио "после смерти Микото кусок в горло не лезет, одни кости да кожа остались", а после все вернулось на круги своя
или же причина может быть в этой милой тян