@morr, 1) Джонатан Джостар никуда не денется, название франшизы тоже. Да, отсылка у его потомков в Японии слегка потеряется. Английское имя тоже не Jotarou, а Joutarou, но никого это почему-то не волнует. Помимо всего этого, Кранчи переводят именно так. Впрочем, я бы просто посоветовал понять разницу между системой записи и произношением и продолжил бы приведение имён к одной системе. Делается не из-за хейта ДжоДжо или его фанатов, а для систематизации энциклопедии.
2) Название и имена пероснажей в разных разделах правил. Кроме того:

По поводу устоявшихся названий: в названиях множества фильмов куча отсебятины лицензионщиков, но из-за продвижения эти названия рано или поздно все равно наберут достаточную популярность. Думаю, такие названия тоже вполне можно ставить после набора достаточного количества результатов поиска.
Кстати, поиск по «лицензировано в РФ под названием» как-то отображается в поисковых результатах гугла, влияет на ранжирование? Если да, то можно было бы оставить официальное название только в этой графе, до тех пор пока опять же оно не станет самым популярным.