Субару догадывается, что Конан это Шиничи, точнее вполне себе уверен, но не на 100% (где-то на 99), и понимает, что раз Конан сам не рассказывает, что он и есть Шиничи Кудо, значит у него есть на это веские причины, и он уважает его приватность.