Он специально не убил Кокуто. По Рио было видно, что для него важнее "завести себе друзей на своей стороне". Даже на момент концовки он был ещё в состоянии между человеком и зверем и, видимо, настолько не хотел убивать ни Микию, ни Шики, что даже в той сцене целился в глаз, а не в жизненно важный орган. Просто этот его блеф перед Шики ещё раз показывает насколько у него мерзкий и слабый характер.