@etojelogin, примеры таких произведений, пжлст. Из топовых аниме, которые я смотрел:
Код Гиас - сюжет с приличным количеством дыр, заделкой которых занимаются на стороне.
Ангельские Ритмы - сюжет дырявый, как решето. Но никому это не мешает смотреть и наслаждаться.
Кланнад - подозреваю, то же, что и с ритмами, ибо автор один, а почерк у него узнаваемый.
Врата штейна - из сюжетных дыр этой анимехи можно собрать логичную теорию, по которой СЕРН - добряки, которые хотели обезвредить будущего террориста.
Мадока - да, в оригинальном сериале, ты не поверишь, тоже есть некоторые дыры и недосказанности. Те же "научное" объяснение кьюбея и то, что он продолжает садистски издеваться над девочками, вместо того, чтобы воспроизвести эффект в чистых условиях.

Восстание - это один фильм, при этом он не основан ни на каком первоисточнике. Ты реально думаешь, что за такой хронометраж возможно разжевать любую мелочь?
Если да, то сочувствую. У тебя идеализированное представление о мире.